税务筹划一般在企业发生纳税事项中之前进行的，根据税务筹划的不同进行阶段，可以将税务筹划划分为三个层面，一是商业层面，税负往往在交易中产生，不同的交易方法会产生不同的纳税税额，通过对商业合同的规划，实现降低交易双方的税负；二是战略层面，也就是在企业刚成立之初或者扩张时，通过对企业不同的注册地点、股权架构、组织形式等，达到未来整体降负的效果。三是税务层面，通过对国家不同的税收优惠政策，扶持政策的解析，积极申请国家优惠，同时提高税务管理规范。
第一层：商业层面
企业在运营、投资项目中，不断通过商业活动、生产经营、并购重组扩大企业利益，而在企业进行各种经营活动时，会产生包括增值税，所得税等各种税负成本，企业因此通过税务筹划，规划交易和商业经营活动，合法、合理的降低税负。
商业模式层面的税务筹划常见的领域包括：
1、资产剥离中，是资产销售还是采取分立的方式；
2、全面营改增后，是购买服务还是内部组建职能公司；
3、企业融资过程中，采取股权融资还是债权融资；
4、并购重组中，选择股权收购还是资产收购；
5、重大交易中涉税条款的拟定与商业目的的实现。
第二层：战略层面
美国政治家本杰明·富兰克林曾说过“世界上只有死亡和税收不可避免”，如果企业在创立之初或者在扩张过程中成立的分支机构，考虑各国各个地区的税负率差异，优惠扶持政策不同等因素，通过税务筹划，可以在之后的运营中降低税负的成本，将利益做到最大化。在目前，大部分的跨国企业在进行全球的投资的过程中都是架构先行，实现企业税负最优化。例如苹果公司的“双层爱尔兰加荷兰三明治架构”，包括亚马逊、谷歌、微笑等百家美国著名跨国企业同样采用此架构。
在企业战略层面引入税务筹划，需要企业的决策层的重视，同事需要借助于公司内外专业的税务专家，根据公司具体情况，制定切实可行的税务筹划方案。
第三层：税务层面
企业内部的税务管理不仅仅是为了满足国家相关税务部门的要求，合法合规的纳税申报，主要的是通过税务筹划优化企业内部的财税管理，协调公司各个部门，积极发现并申请国家各个税收政策优惠，同时控制企业潜在税务风险。
目前，随着国内的税法和税务管理逐步的完善和精细化，企业税务筹划也需要规范，并且具有一定的前瞻性。并在企业潜在的税务处理妥善，完整，防止潜在的税务风险影响到企业未来投资和上市。
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